Что со скалярией???

Марина, вы воду подкисляли? если да то это все обьясняет. Налицо признаки химического ожога, резкое изменение рН можеи привести к такому состоянию. Если же это не подтвердится, тогда возможно это инфекционное заболевание. Проверьте рН в нерестовике и емкости, где они содержались до этого.

Похоже на инфекцию , для начала повысить температуру до 30-31 градуса , и увеличить продувку , если есть чтото из рыбьих лекарств , пишите

Все дело в том, что самец все это время сидел с самкой, у него ничего подобного не наблюдается, если б это было pH (оно одинаково, и в нерестовнике и в общем аквариуме) или инфекция, страдали бы оба!...

Не проще ли было забрать икру из общего аквариума?

Нет не проще, если она (икра) оказывается на стекле, а не на предмете (специально им предоставленном), при ее соскребании разлетается и поедается всеми кому не лень... и я не думаю, что это так страшно-отсадить скалярий в отдельную банку на нерест! Тем более, что вода в нем наполовину (больше) состоит из воды из общего акв. Да и хотелось все таки понаблюдать, будут иль нет мои скалярии ухаживать за своим потомством...

Ну раз причина найдена нужно превращать нерестовик в лазарет. Меняйте почаще воду, температура 27-28 градусов, и капнуть метиленовой синьки до бледно голубого цвета.